Mai-Otome ZWEI

อาเรียกลายเป็นโอโตเมเต็มตัวแล้ว โดยยังคงฝึกฝนทักษะภายใต้การดูแลของมิส มาเรีย ในขณะที่นาจิถูกจำคุกอยู่ในอาเรียส์ ด้วยความสงบสุขที่แผ่ขยายไปทั่วโลก ประเทศต่างๆ จึงเตรียมพร้อมสำหรับ S.O.L.T. เพื่อควบคุมจำนวนโอโตเม ภารกิจในการกำจัดดาวหางที่คุกคามเอิร์ลได้ก่อให้เกิดเหตุการณ์ต่อเนื่อง รวมถึงการโจมตีทั้งการ์เดอโรบ์และโอโตเมหลายคนโดยผู้โจมตีที่ไม่เป็นที่ทราบ กลายพันธุ์ใหม่ที่ทรงพลังกว่าเดิมของสเลฟปรากฏขึ้นทั่วโลก หลังจากมีข้อขัดแย้งกับอาเรีย ควีน มาชิโร่ก็หายตัวไป นิยายมุ่งเน้นไปที่ความพยายามของอาเรียในการค้นหาตำแหน่งของมาชิโร่ และการสืบสวนของการ์เดอโรบ์เพื่อหาตัวผู้โจมตีลึกลับ