第 22 集: 櫻被 Festum 同化的真相在擊潰三名敵人後浮現，眾人面臨全新威脅
2004年12月6日 播出
櫻在近期的外星入侵期間被 Rare Type Festum 同化的事實曝光。駕駛員們擊潰三台 Festum 後，對櫻住院的消息感到震驚。Fumihiko 就連串外星入侵事件以及島嶼氣候與生態的異變向 Tsubaki 提出詰問。基地內針對將 Siegfried System 整合進 Fafner Mark Sein 一事展開討論。一台新型 Festum 現身並抵銷所有駕駛員的攻擊，令眾人無法反擊。Mamoru 拼死試圖使敵人失去行動能力，Kazuki 則成功將長槍刺穿敵身。然而，Mamoru 在此過程中不幸喪生。
集數
- 第 18 集 · 道子和卡農安頓下來，而光弘在監護權審判中挑戰瑪雅的偽造測試結果
- 第 19 集 · 瑪雅進行狙擊手訓練，飛行員於骨祭通知期間迎戰Festum攻擊
- 第 20 集 · 燈籠準備啟動，Canon 與 Sakura 在外星入侵後和解
- 第 21 集 · 櫻華於週末訓練前放鬆，文彥懷疑外星人調虎離山
- 第 22 集 · 櫻被 Festum 同化的真相在擊潰三名敵人後浮現，眾人面臨全新威脅
- 第 23 集 · 由紀被伊登同化，和樹與同伴們在失去與宗史失蹤的陰影中掙扎。
- 第 24 集 · Akane 仍處於同化狀態，Mjolnir 抵達提供數據以恢復受 Festum 同化影響的人員。
- 第 25 集 · 天空（蒼穹）
- 第 26 集 · The Sky (Azure)