Boku no Gakkou no Ansatsu-bu

福山玲治身高157公分，比同齡女生略矮，這讓他覺得很困擾。他遇見了同班同學三島由佳里，她犯下了一樁謀殺案。她是隸屬於一個名為「暗殺科」的組織，專門針對社會上的特定人物。在對由佳里產生感情後，玲治選擇加入這個組織。故事描寫他如何在成長、人際關係與邁入槍械世界的挑戰中掙扎前行。