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Ein globales Unglück namens "Hammer of Eden" tötete sechs Milliarden Menschen und versenkten 90 Prozent der Landflächen. Vierzehn Jahre später wurde die Neue Vereinte Nationen gegründet, um Frieden in der zerstörten Welt zu fördern. Ein Junge namens Keel lebt in Yabitsu, einer Stadt, die durch Energie von einem nach dem Unglück eingeführten Atomgenerator gedieh. Aoi, Keels Verwandte, fungiert als Generalsekretärin der Neuen Vereinten Nationen und glaubt, dass die Katastrophe eine Chance bietet, eine kooperative Welt jenseits rassischer und religiöser Unterschiede aufzubauen. Ihren Versuchen, dieses Ziel zu verwirklichen, steht Widerstand aus Ländern entgegen, die sich nicht anpassen wollen. Gould, ein Militärführer, behauptet, dass nur militärische Gewalt Ordnung schaffen könne. Mit der Atomunterseeboots Ulysses und seiner Besatzung, zu der auch Keels Bruder Tean gehört, startet Gould einen Putsch und greift Yabitsu an, um die Neue Vereinte Nationen herauszufordern.