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गारन, किबा और एयरा आर्मी नामक तीन सैन्य समूहों के बीच बाहरी दुनिया से अलग एक दूरस्थ और संसाधनों से भरपूर स्थान मशीन आइलैंड पर नियंत्रण के लिए संघर्ष चल रहा है। द्वीप के प्रचुर संसाधनों के कारण प्रत्येक पक्ष द्वारा बड़े स्तर के मेक का निरंतर उत्पादन संभव हो पाता है। एक संकट तब उत्पन्न होता है जब द्वीप की पावर रिएक्टर अस्थिर हो जाती है, जिसके विस्फोट की 66 घंटों के भीतर संभावना है और यह पृथ्वी पर मौजूद सभी जीवन को नष्ट कर सकता है। इस स्थिति को संभालने के लिए विश्व सरकार ने डेथ कैप्रिस यूनिट को तैनात किया, जिसमें मेर्सेनरीज केन कैइडो और र्यो मागामी शामिल हैं, और उनके साथ उनका मेका मज़िनकैसर भी है। क्या यह निर्णय प्रभावी साबित होगा, यह अभी अनिश्चित है।