第13話: エドワードはマルコフと賢者の石に関する情報を得るため、マスタングとの決闘を申し込む。
2003年12月27日 放送

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エドワードとアルフォンスはマスタングに賢者の石の調査について報告する一方、フューリーは迷子犬の里親探しに失敗する。マスタングとヒューズはエドとマルコフについて話し合うが、グランドが割り込み、マルコフを逃亡者であると名指しする。エドは情報と引き換えに再認定を要求し、パレードグラウンドでの公式決闘が成立する。マスタングはエドワードをほぼ倒すものの、躊躇のため反撃を許す。試合を中止した後、マスタングはマルコフの詳細を明かす。その夜、ヒューズはブラッドリーの行動に関与したスカーという男の存在を告白する。この展開は、エドワード兄弟の個人的な利害と、行方不明の錬金術師および謎の男スカーを取り巻く軍部の陰謀とを結びつける。
話数
- 第9話 · エドワードがユーズウェル炭鉱を視察し、腐敗した軍司令官のヨキ中佐とその使用人ライラと対峙する
- 第10話 · エルリック兄弟、アクロワヤ警察が錬金術師の窃盗犯サイレンを追うのを手伝い、その動機を問う
- 第11話 · エルリック兄弟はゼノタイムで賢者の石を求め、ラッセルとフletcher・トリンガムという偽者たちを回避する
- 第12話 · ムーゲールがトリンガム兄弟を捕らえ、エルリック兄弟がナッシュ・トリンガムの過去の研究を追う
- 第13話 · エドワードはマルコフと賢者の石に関する情報を得るため、マスタングとの決闘を申し込む。
- 第14話 · リオルで envy が Cornello に成りすまし、Scar が Grand を殺害、Elrics が Armstrong と共に脱出
- 第15話 · アームストロングがスカーのイシュヴァール人であることを明かし、マルコフが国家錬金術師の虐殺を語る
- 第16話 · アームストロングがエドワードとアルフォンスをレスムブルへ護衛し、ラスはマルコフを狙う
- 第17話 · エルリック兄弟がレゼンブルに戻り、エドを修理し、アルの体を回復させる