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人間と「未知なるもの」との戦いは続いています。何十年も前、侵攻が行われた際、子どもたちは冷凍施設に入れられていました。目覚めた彼らは、超常な能力を身につけていることに気づきます。東京湾に現れたゲートを通じて現れる「未知なるもの」から、東京、神奈川、千葉の都市を守るために、彼らは戦いを繰り広げます。