Kidou Senkan Nadesico: The prince of darkness

สองปีหลังเหตุการณ์ใน "Martian Successor Nadesico" อาคิโตะและยูริกะหายสาบสูญ ชาวดาวพฤหัสบดีและมนุษย์โลกได้จัดตั้งพันธมิตร โดยรุริเป็นผู้บัญชาการ Nadesico B ขณะที่การเดินทางด้วย Boson Jumping ได้รับความนิยมเพิ่มขึ้น ระบบขนส่งที่เรียกว่า Hisago Plan ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ประตู Chulip เพื่อศึกษาอนุภาค Bose และศักยภาพของมัน ความกังวลเกิดขึ้นว่าความรู้นี้อาจถูกใช้ไปในทางที่ผิด กลุ่มฝ่าย-Martian ได้เริ่มการโจมตี ทำให้กองกำลังสหภาพสับสนและล่มสลาย ในทางตอบสนอง ลูกเรือต้นฉบับของ Nadesico ถูกเรียกตัวกลับมาเพื่อปฏิบัติภารกิจลับเพื่อป้องกันภัยพิบัติ ผลลัพธ์ของการต่อสู้เพื่อเทคโนโลยี Boson ยังคงไม่แน่นอน รวมถึงชะตากรรมของอาคิโตะและยูริกะด้วย