SSS!

นาเดสิโกะ โอเตมาจิ เสียครอบครัวไปในเหตุการณ์โจมตีจากกลุ่มผู้ก่อการร้าย เมื่อเวลาผ่านไปหลายปี เธอจึงเข้าร่วมโรงเรียนทหารเพื่อช่วยปกป้องเนโอโตเกียว เพื่อหลีกเลี่ยงสถานการณ์ที่ไม่พึงประสงค์ เธอจึงตัดสินใจเข้าร่วม S Class ซึ่งเป็นโครงการสำหรับนักเรียนที่มีความสามารถสูงสุดของโรงเรียนนี้ อย่างไรก็ตาม S Class และสมาชิกผู้มีอันดับสูงในโครงการนี้กลับแตกต่างจากที่เธอคาดคิดไว้มากนัก