21. Bölüm: Isshiki'nin TERRA'yı ele geçirmesi ilişkileri gererken Mamoru, Hiroko'nun geçmişini ve Ayato'nun sırlarını ortaya çıkarır.
31 Temmuz 2002 tarihinde yayınlandı

21
Tempers and attitude flare as Isshiki`s take-over of TERRA begins to take its toll. Mamoru finally learns what happened to Hiroko when she came over with Ayato. (Source: HIDIVE) Souichi and Haruka draws out Makoto's plans for another operation to break the barrier of Tokyo Jupiter. Quon is again settled in at the Bähbem Foundation. Mamoru recognizes Reika as Ixtli when she and Makoto come to see Ayato. Mamoru tries to gather information from Megumi to learn more about Ayato. After reading Hiroko's diary and hearing Megumi's voice message, Mamoru tells Ayato that one day he will be forced to decide between the paths of red and blue. (Source: Wikipedia)
Bölümler
- 17. Bölüm · Elvy, Ayato ve Quon'u takip ederken RahXephon, Tokyo Jupiter'da Dolem tehditleriyle karşı karşıyadır.
- 18. Bölüm · Ayato ve Hiroko, RahXephon Dolem Falsetto ile savaştıktan sonra Tokyo Jupiter'den kaçar
- 19. Bölüm · Ayato, Vibrato ve Futagami'nin takibiyle baş etmeye çalışırken Tokyo Jupiter'den kaçar
- 20. Bölüm · Ayato, Isshiki'nin kontrolündeki TERRA'ya dönerken, Mamoru Tokyo'dan kaçtıktan sonra Ayato ve Megumi ile yeniden buluşur.
- 21. Bölüm · Isshiki'nin TERRA'yı ele geçirmesi ilişkileri gererken Mamoru, Hiroko'nun geçmişini ve Ayato'nun sırlarını ortaya çıkarır.
- 22. Bölüm · Ayato ve Quon, erken operasyon sonrası Makoto görevden alındıktan sonra Ixtli ile karşı karşıya gelir.
- 23. Bölüm · Mulian güçleri RahXephon'un teslim olmasını isterken Kunugi, Jüpiter sistemi cihazını devreye sokmak için geride kalır
- 24. Bölüm · Ayato, TERRA ve Mulian Kuvvetleri Arasındaki Savaş Ortamında Yolunu Seçer
- 25. Bölüm · Ayato ve Quon, şehir yıkım arasında RahXephon ikiye bölünürken aralarındaki bağı ortaya çıkarır.