SHY: Tokyo Dakkan-hen

Sau khi chiến đấu với 'Amalareik' và vị lãnh đạo bí ẩn Stigma, Shy trở về Nhật Bản và gặp Ai Tennouji, một cô gái đã trốn khỏi làng ninja của mình để truy tìm một thành viên trong nhóm đó. Chẳng bao lâu sau, Tokyo bị nuốt chửng bởi một quả cầu đen và biến mất. Shy cùng những người khác được cử đi thu phục lại thành phố.