Ep. 13: Accelerator mengganggu sabotase Tree Diagram sementara Misaka menargetkan sebuah laboratorium dan Kamijou mencari adiknya.
Tayang pada 5 Juli 2013

Thwarted in her attempt to sabotage Tree Diagram, Misaka takes her frustration out on a nearby lab that is part of the project. Meanwhile, Accelerator and #10031 carry out their experiment, while Kamijou searches for Misaka's missing sister. (Source; FUNImation)
Episode
- Ep. 9 · Misaka dan Mugino terlibat dalam permainan kucing dan tikus sementara Nunotaba menyusup ke fasilitas untuk mengubah eksperimen.
- Ep. 10 · Mugino menantang peringkat Misaka sementara Misaka menggunakan bom-bom boneka yang ditinggalkan Frenda untuk meningkatkan kemampuannya yang melemah.
- Ep. 11 · Misaka dan Kamijou bertemu kembali di mesin penjual otomatis yang rusak, sementara Shirai salah paham mengenai hubungan mereka.
- Ep. 12 · Misaka menargetkan superkomputer Tree Diagram untuk menghentikan eksperimen, sementara Kamijo membantu kloning #10032 dengan seekor anak kucing liar.
- Ep. 13 · Accelerator mengganggu sabotase Tree Diagram sementara Misaka menargetkan sebuah laboratorium dan Kamijou mencari adiknya.
- Ep. 14 · Kamijou menghadapi Misaka di atas jembatan sementara Shirai mengkhawatirkannya karena pulang terlambat.
- Ep. 15 · Kamijou Touma tiba di lokasi eksperimen dan menghadapi Accelerator
- Ep. 16 · Misaka membela klon #10032 sebagai saudara perempuan dan berupaya berterima kasih kepada Kamijou
- Ep. 17 · Para gadis merencanakan sesi belajar dan pesta rebusan potluck di apartemen Saten sebelum musim panas berakhir.