Ep. 13: Accelerator interrompe il sabotaggio del Tree Diagram mentre Misaka punta a un laboratorio e Kamijou cerca sua sorella.
In onda il 5 luglio 2013

Dopo che i suoi sforzi per sabotare il progetto Tree Diagram vengono sventati, Misaka sfoga la sua frustrazione su un laboratorio vicino associato all'iniziativa. Nel frattempo, Accelerator e #10031 proseguono con il loro esperimento in corso. Allo stesso tempo, Kamijou cerca attivamente la sorella scomparsa di Misaka. Questi eventi paralleli si svolgono mentre i personaggi perseguono i rispettivi obiettivi nel contesto più ampio delle attività del progetto.
Episodi
- Ep. 9 · Misaka e Mugino si affrontano in una partita a nascondino mentre Nunotaba si infiltra in una struttura per alterare l'esperimento.
- Ep. 10 · Mugino sfida il rango di Misaka mentre Misaka usa le bombe-bambola abbandonate da Frenda per potenziare le sue capacità indebolite.
- Ep. 11 · Misaka e Kamijou si ritrovano davanti a un distributore rotto mentre Shirai fraintende la loro relazione
- Ep. 12 · Misaka punta al supercomputer Tree Diagram per fermare gli esperimenti mentre Kamijo aiuta il clone #10032 con un gatto randagio.
- Ep. 13 · Accelerator interrompe il sabotaggio del Tree Diagram mentre Misaka punta a un laboratorio e Kamijou cerca sua sorella.
- Ep. 14 · Kamijou affronta Misaka su un ponte mentre Shirai si preoccupa per il suo ritardo nel ritorno.
- Ep. 15 · Kamijou Touma arriva al sito dell'esperimento e affronta Accelerator
- Ep. 16 · Misaka difende la clonata #10032 come una sorella e cerca di ringraziare Kamijou
- Ep. 17 · Le ragazze organizzano una sessione di studio e una cena a base di stufato a casa di Saten prima della fine dell'estate.