Ep. 46: Flay fugge da Rau con i dati del Neutron Jammer mentre Kira la salva con grande sacrificio per la Freedom.
In onda il 30 agosto 2003
Flay, precedentemente tenuta prigioniera da Rau, viene collocata in una capsula di salvataggio contenente i dati del Neutron Jammer Canceller. Trasmette con successo queste informazioni al Dominion e all'Archangel. All'udire la trasmissione, Kira si precipita a soccorrere Flay ma lascia incustodito il suo mobile suit, la Freedom, che viene colpita alla testa. Athrun interviene per salvare la Freedom e la riporta all'Archangel. Il Dominion assicura Flay, permettendo a Muruta Azreal di raggiungere il suo obiettivo originale. In seguito, a bordo dell'Eternal, Kira sviene. Al risveglio, viene confortato dai suoi amici e da Lacus, che lo aiutano a liberarsi dallo stress mentale accumulato.
Episodi
- Ep. 42 · Lacus e Andrew Waltfeld salvano Athrun e formano l'Alleanza delle Tre Navi
- Ep. 43 · L'Alleanza delle Tre Navi si rifugia nella colonia Mendel mentre ZAFT e l'Alleanza Terrestre li rintracciano.
- Ep. 44 · Mu e Dearka entrano nella colonia per affrontare Rau mentre Kira arriva per aiutarli.
- Ep. 45 · Kira e Mu affrontano Rau mentre Dearka e Yzak mettono in discussione la loro causa mentre le forze si scontrano
- Ep. 46 · Flay fugge da Rau con i dati del Neutron Jammer mentre Kira la salva con grande sacrificio per la Freedom.
- Ep. 47 · L'Alleanza Terrestre attacca i PLANT con armi nucleari mentre Freedom e Justice intercettano le testate.
- Ep. 48 · GENESIS colpisce le forze dell'Alleanza Terrestre mentre gli equipaggi pregano per la sicurezza
- Ep. 49 · Le forze dell'Alleanza Terrestre falliscono mentre Mu si sacrifica per salvare l'Archangel dall'attacco finale di Muruta.
- Ep. 50 · L'Arcangelo e l'Eterno si scontrano per impedire l'uso di armi di distruzione di massa.