Persona x Tantei Naoto

Un anno dopo gli eventi di Persona 4, Naoto viene chiamata da un'ex detective, Touko Aoi, per indagare sulla scomparsa di due studenti di Yagakoro. Le viene affiancato Sousei Kurogami, un detective meccanico il cui approccio e la cui personalità contrastano fortemente con i suoi. Durante il loro primo incontro, Naoto acquisisce un nuovo persona, Amatsu Mikaboshi, che potenzia l'abilità di Tsukuyomi di Sousei. Scoprono il Midnight Site, una piattaforma online in cui cinque giudici, intitolati a figure della mitologia giapponese, emettono giudizi su altri. Il caso si complica quando uno dei giudici viene trovato morto, con prove che collegano l'omicidio a un poliziotto scomparso. Naoto e Sousei cercano di identificare gli altri giudici e di scoprire la persona responsabile delle uccisioni.