Koukaku Kidoutai: Stand Alone Complex 2nd GIG

사이버네틱스와 인터넷이 전통적인 사회적 경계를 허물어버린 미래, 공안 9과는 급증하는 사이버 범죄 대응을 위해 재편성된다. 그들은 서로 다른 집단에 의해 저지르고 그 행동 이후 자살하는 일련의 범죄 사건을 수사하는데, 이 사건들은 통틀어 "개인 일레븐(The Individual Eleven)"으로 불린다. 상황이 악화되면서 팀은 전쟁의 영향으로 급증하는 난민들의 유입이라는 문제도 함께 해결해야 한다.