9S

Yükselmiş bilimlerin egemen olduğu uzak bir gelecekte, hikâyenin başlangıcından yıllar önce "Delikanlı Bilimadam" olarak bilinen Mineshima Yujiro adlı bir figür kaybolur. O, eserlerinin toplu adı olan "Miras" olarak anılan yaratıkları bırakarak yok olur. Bu miras, hükümetler ve terörist gruplar gibi çeşitli tarafların farklı amaçlarla peşine düşmesine neden olur. Bu yaratıklardan biri, süper bilgisayarları bile aşan inanılmaz bir hesaplama zekâsına sahip ve bu yeteneğini artıran fiziksel bir yapıya kavuşmuş bir kızdır.