Ep. 12: Quon desaparece del hospital mientras Ayato enfrenta a un Dolem que amenaza al RahXephon.
Emitido el 1 de mayo de 2002
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Quon entra en estado catatónico y es hospitalizada, pero desaparece repentinamente, lo que desencadena una búsqueda. Tras que Itsuki y Sayoko abandonan el laboratorio, Quon despierta y escapa con Reika, quien está vinculada a ella a través de los recuerdos. Mientras tanto, Ayato camina con Futagami, quien le muestra una foto de Maya como líder de los Mulians. Se localiza un Dolem y Ayato es enviado a encontrarlo. Cuando el Dolem envuelve al RahXephon, Quon alcanza un huevo negro similar al que Ayato encontró dentro de Tokyo Jupiter, aunque aún no ha despertado por completo. Ayato logra atravesar al Dolem y lo parte por la mitad.
Episodios
- Ep. 8 · Itsuki organiza una fiesta de Navidad mientras Sayoko se convierte en el Dolem Sforzando de hielo durante la primera nevada.
- Ep. 9 · Ayato y Quon visitan un santuario misterioso el primer día del año mientras Haruka los busca.
- Ep. 10 · Quon toca una melodía extraña mientras Kunugi busca el cierre para su hija Michiru
- Ep. 11 · Ayato enfrenta el fallo del soporte vital y encuentros surrealistas mientras confronta su destino como instrumentalista de RahXephon.
- Ep. 12 · Quon desaparece del hospital mientras Ayato enfrenta a un Dolem que amenaza al RahXephon.
- Ep. 13 · Investigación sobre los orígenes de Quon y el experimento del primer espécimen humano
- Ep. 14 · Toma corporativa de Quon y el descubrimiento por parte de Ayato de su herencia Mulian
- Ep. 15 · Itsuki, Helena e Isshiki viven como estudiantes mientras Makoto recuerda proteger a una Muñeca de Barro
- Ep. 16 · Ayato considera regresar a Tokyo Jupiter mientras lidia con verdades ocultas sobre su identidad Mulian.