Ep. 14: Toma corporativa de Quon y el descubrimiento por parte de Ayato de su herencia Mulian
Los intereses corporativos toman el control de Quon, lo que lleva a Helena von Bähbem a descubrir detalles sobre su despertar más allá del conocimiento de Itsuki. Futagami revela a Haruka que Rikudo tuvo una hija que dejó Tokio a los diecisiete años y cambió su nombre a Kamina. Llega una nueva arma de Terra, The Vermillion, para Elvy, pero Souichi prohíbe su uso en combate, lo que provoca una discusión que Ayato escucha, llevándolo a descubrir que es Mulian. Cuando los Dolems se acercan, el Vermillion se lanza, seguido por el RahXephon. Atrapado en un cielo enmascarado, Ayato se sorprende cuando Reika controla el RahXephon de forma independiente, disparando a Elvy para romper la barrera. Elvy derrota a los Dolems en solitario, dejando a Ayato frustrado por su aparente obsolescencia en la batalla.
Episodios
- Ep. 10 · Quon toca una melodía extraña mientras Kunugi busca el cierre para su hija Michiru
- Ep. 11 · Ayato enfrenta el fallo del soporte vital y encuentros surrealistas mientras confronta su destino como instrumentalista de RahXephon.
- Ep. 12 · Quon desaparece del hospital mientras Ayato enfrenta a un Dolem que amenaza al RahXephon.
- Ep. 13 · Investigación sobre los orígenes de Quon y el experimento del primer espécimen humano
- Ep. 14 · Toma corporativa de Quon y el descubrimiento por parte de Ayato de su herencia Mulian
- Ep. 15 · Itsuki, Helena e Isshiki viven como estudiantes mientras Makoto recuerda proteger a una Muñeca de Barro
- Ep. 16 · Ayato considera regresar a Tokyo Jupiter mientras lidia con verdades ocultas sobre su identidad Mulian.
- Ep. 17 · Elvy persigue a Ayato y a Quon mientras el RahXephon enfrenta amenazas de Dolem en Tokyo Jupiter.
- Ep. 18 · Ayato y Hiroko huyen de Tokio Júpiter tras la batalla de RahXephon contra Dolem Falsetto