Ep. 14: L'acquisizione aziendale di Quon e la scoperta da parte di Ayato delle sue origini muliane

Interessi aziendali prendono il controllo di Quon, spingendo Helena von Bähbem a scoprire dettagli sul suo risveglio oltre la conoscenza di Itsuki. Futagami rivela a Haruka che Rikudo aveva una figlia che lasciò Tokyo a diciassette anni e cambiò il suo nome in Kamina. Una nuova arma di Terra, The Vermillion, arriva per Elvy, ma Souichi ne vieta l'uso in combattimento, scatenando una discussione che Ayato sente, portandolo a scoprire di essere muliano. Quando i Dolems si avvicinano, il Vermillion si lancia, seguito dal RahXephon. Intrappolato in un cielo mascherato, Ayato è sorpreso quando Reika controlla il RahXephon in modo indipendente, colpendo Elvy per frantumare la barriera. Elvy sconfigge i Dolems da solo, lasciando Ayato frustrato dalla sua percepita obsolescenza in battaglia.
Episodi
- Ep. 10 · Quon suona una strana melodia mentre Kunugi cerca una chiusura per sua figlia Michiru
- Ep. 11 · Ayato affronta il guasto ai sistemi di supporto vitale e incontri surreali mentre si confronta con il suo destino di strumentista del RahXephon.
- Ep. 12 · Quon scompare dall'ospedale mentre Ayato affronta un Dolem che minaccia il RahXephon.
- Ep. 13 · Indagine sulle origini di Quon e sull'esperimento del primo esemplare umano
- Ep. 14 · L'acquisizione aziendale di Quon e la scoperta da parte di Ayato delle sue origini muliane
- Ep. 15 · Itsuki, Helena e Isshiki vivono come studenti mentre Makoto ricorda di aver protetto una Bambola di Fango
- Ep. 16 · Ayato considera il ritorno a Tokyo Jupiter mentre affronta le verità nascoste sulla sua identità di Mulian.
- Ep. 17 · Elvy insegue Ayato e Quon mentre il RahXephon affronta le minacce dei Dolem a Tokyo Jupiter.
- Ep. 18 · Ayato e Hiroko fuggono da Tokyo Jupiter dopo la battaglia tra RahXephon e Dolem Falsetto