Ep. 16: Armada Neo PBB mengamankan basis Alvis sementara Seri dan Tsubaki bertemu kembali sebelum serangan Festum.
Tayang pada 25 Oktober 2004
Armada Neo PBB mengambil alih kendali basis Alvis, namun menghadapi serangan baru Festum di pulau tersebut. Seri Tatekami diketahui berada bersama inti perempuan pulau, yang teridentifikasi sebagai Tsubaki Minashiro, sebelum kembali ke basis. Chizuru menemukan Tsubaki dan mengawalinya ke mercusuar. Tsubaki kemudian membimbing Fumihiko dan Soushi ke pusat komando kedua. Mamoru, Kenji, dan Sakura berjuang melawan Festum namun akhirnya dikalahkan. Kazuki tiba dengan Fafner Mark Sein, menyinkronkan diri dengan Soushi, dan menghancurkan musuh menggunakan senapan rifle dilanjutkan dengan pedang tombak.
Episode
- Ep. 12 · Mamoru dan lainnya mengemudikan Fafner melawan Festum sementara Kazuki menghadapi penahanan dan perasaan tersembunyi Soushi muncul.
- Ep. 13 · Mitsuhiro menjelaskan kehancuran Jepang dan genosida Festum sementara Hester memperkenalkan senjata baru.
- Ep. 14 · Maya dan Kyouhei menyelamatkan Kazuki saat Neo UN menyerang basis Alvis untuk inti Festum.
- Ep. 15 · Kazuki menghadapi Idun di kawah lava sambil merenungkan trauma masa lalu dan implan kristalnya.
- Ep. 16 · Armada Neo PBB mengamankan basis Alvis sementara Seri dan Tsubaki bertemu kembali sebelum serangan Festum.
- Ep. 17 · Maya membagikan data saat Kyouhei melaporkan pengorbanan Yoki, identitas Tsubaki terungkap, dan Canon mengaktifkan Sistem Fenrir.
- Ep. 18 · Michio dan Canon menetap sementara Mitsuhiro menantang hasil tes palsu Maya dalam persidangan hak asuh
- Ep. 19 · Maya berlatih sebagai penembak jitu sementara para pilot menghadapi serangan Festum saat peringatan festival tulang.
- Ep. 20 · Persiapan lentera dimulai saat Canon dan Sakura rekonsiliasi setelah invasi alien.