Ep. 12: Mamoru dan lainnya mengemudikan Fafner melawan Festum sementara Kazuki menghadapi penahanan dan perasaan tersembunyi Soushi muncul.
Tayang pada 27 September 2004
Mamoru Kodate, Kenji Kondo, dan Sakura Kaname dipilih sebagai kandidat untuk mengemudikan Fafner. Secara bersamaan, Kazuki dan Yukie mempertanyakan alasan di balik penahanan mereka. Saat Festum baru mendekat, para pilot baru ini diuji untuk mengalahkannya. Mamoru menyusun rencana yang mengabaikan perintah spesifik Soushi. Ketiganya berhasil mengalahkan Festum secara kolaboratif namun kemudian dipenjarakan karena bertindak atas penilaian mereka sendiri. Sementara itu, Soushi mengetahui dari Fumihiko bahwa Kazuki menolak dirinya sendiri setiap hari, melewati asimilasi apa pun. Maya menyadari bahwa Soushi memiliki perasaan terhadap Kazuki. Michio membawa Kazuki ke dek kapal, di mana mereka juga bertemu Canon, sebelum tiba di basis Moldova.
Episode
- Ep. 8 · Tim menjelajahi pulau itu sementara Maya merawat personel yang terluka dan Koyo muncul dari inti merah.
- Ep. 9 · Koyo diserang Festum dan terseret ke laut saat orang tuanya diasingkan.
- Ep. 10 · Kazuki mengingat telah melukai Soushi sementara Hiroto memberontak sebelum Maya berkunjung dan Kazuki menunjukkan pertumbuhan kristal.
- Ep. 11 · Kazuki dan Yukie meninggalkan pulau dengan Mark Elf, tiba di kota di mana mereka menghadapi Festum dan ditangkap oleh pasukan Neo UN.
- Ep. 12 · Mamoru dan lainnya mengemudikan Fafner melawan Festum sementara Kazuki menghadapi penahanan dan perasaan tersembunyi Soushi muncul.
- Ep. 13 · Mitsuhiro menjelaskan kehancuran Jepang dan genosida Festum sementara Hester memperkenalkan senjata baru.
- Ep. 14 · Maya dan Kyouhei menyelamatkan Kazuki saat Neo UN menyerang basis Alvis untuk inti Festum.
- Ep. 15 · Kazuki menghadapi Idun di kawah lava sambil merenungkan trauma masa lalu dan implan kristalnya.
- Ep. 16 · Armada Neo PBB mengamankan basis Alvis sementara Seri dan Tsubaki bertemu kembali sebelum serangan Festum.