第8話: チームが島を探索し、マヤが負傷者を治療し、コヨウが赤いコアから現れる
2004年8月30日 放送
チームは無人と思われる島に到着し、各部隊が探索に出発する。マヤは潜水艦格納庫での負傷者の治療のために呼び出される。その間、他の者たちは放棄された指揮センター内で島の周囲にフェストムの群れを呼び寄せる赤い男性のココアを見つける。溝口恭平は格納庫にいるマヤを見つけるが、狩谷由紀江によって自爆シーケンスの起動を強要される。宗司はコヨウがマヤと恭平を地下から海へ救助することを許し、一方、一樹と桜は地上でフェストムと戦うのを助ける。
話数
- 第4話 · 島が移動する中、フェストゥムに追跡される飛行機を救助するためカズキは命令に背く
- 第5話 · フェスチュームによる接近中の艦隊と島への攻撃、ヘスター・ガロップによるファフナー マーク セクスの要求
- 第6話 · Festum 破壊のため自爆する Shoko 、 Kazuki が最初の脅威に対処する
- 第7話 · 紅葉は翔子を追悼し、桜はペイントボール訓練中に死を勇気と見なす一方、染色体の変化が起きる
- 第8話 · チームが島を探索し、マヤが負傷者を治療し、コヨウが赤いコアから現れる
- 第9話 · 父母を追放され、コヨウがフェストゥムに襲われ海へ引きずり込まれる
- 第10話 · 下志の怪我の原因を思い出す和樹、反抗する広人、マヤの訪問と和樹の結晶成長
- 第11話 · 真壁一騎と由紀江はマークエルフと共に島を離れ、フェストムとネオUN軍に襲われ捕らえられる街へ到着する
- 第12話 · マモル他、ファフナーでフェストムと戦う中、カズキは収容され、ソウシの隠れた感情が浮上する