Tập 8: Đội khám phá hòn đảo trong khi Maya điều trị cho nhân viên bị thương và Koyo xuất hiện từ lõi đỏ.
Phát sóng ngày 30 tháng 8, 2004
Đội đến hòn đảo dường như không người ở, và các đơn vị khác nhau bắt đầu khám phá. Maya được triệu đến để điều trị những người bị thương trong nhà chứa tàu ngầm. Trong khi đó, một số người khác tìm thấy một lõi đỏ nam giới bên trong trung tâm chỉ huy bỏ hoang, người bao quanh hòn đảo với một đàn Festums. Kyouhei Mizoguchi tìm thấy Maya, người vẫn còn trong nhà chứa, tuy nhiên anh ta bị Yukie Kariya buộc phải kích hoạt chuỗi tự hủy. Soushi cho phép Koyo cứu Maya và Kyouhei xuống đại dương, trong khi Kazuki và Sakura giúp chiến đấu chống lại Festums trên bề mặt.
Số tập
- Tập 4 · Kazuki bất tuân lệnh để giải cứu một chiếc máy bay bị Festum truy đuổi khi hòn đảo di chuyển.
- Tập 5 · Hester Gallop yêu cầu chuyển giao Fafner Mark Sechs trong khi Festum tấn công hạm đội và hòn đảo đang tiến lại gần.
- Tập 6 · Shoko hy sinh bản thân để tiêu diệt Festum trong khi Kazuki đối phó với mối đe dọa đầu tiên.
- Tập 7 · Koyo thương tiếc Shoko trong khi Sakura xem cái chết là dũng cảm trong buổi tập bắn sơn và sự thay đổi nhiễm sắc thể.
- Tập 8 · Đội khám phá hòn đảo trong khi Maya điều trị cho nhân viên bị thương và Koyo xuất hiện từ lõi đỏ.
- Tập 9 · Koyo bị Festum tấn công và bị kéo xuống biển trong khi cha mẹ anh bị trục xuất.
- Tập 10 · Kazuki nhớ lại việc gây thương tích cho Soushi trong khi Hiroto nổi loạn trước khi Maya ghé thăm và Kazuki thể hiện sự phát triển của tinh thể.
- Tập 11 · Kazuki và Yukie rời đảo cùng Mark Elf, đến một thành phố nơi họ đối mặt với Festum và bị lực lượng Neo UN bắt giữ.
- Tập 12 · Mamoru và những người khác điều khiển Fafners chống lại Festum trong khi Kazuki đối mặt với sự giam cầm và những cảm xúc giấu kín của Soushi trỗi dậy.