8화: 팀이 섬을 탐험하고 마야가 부상자를 치료하며 코요가 레드 코어에서 등장한다.
2004년 8월 30일 방영
팀이 외관상 무인도인 섬에 도착하고, 여러 부대가 섬을 탐험하기 위해 출동한다. 마야는 잠수함 격납고에서 부상당한 사람들을 치료하라는 소환을 받는다. 한편, 다른 이들은 버려진 지휘 센터 안에 섬을 페스텀 군단으로 둘러싼 붉은색 남성 코어를 발견한다. 미조구치 키오헤이에게 격납고에 남아 있는 마야를 찾지만, 가리아 유키에에 의해 자폭 시퀀스를 활성화하도록 강요받는다. 소우는 코요가 마야와 키오헤이를 지하에서 바다로 구출하도록 허용하고, 가즈키와 사쿠라는 지상에서 페스텀을 물리치는 데 도움을 준다.
에피소드 수
- 4화 · 섬이 이동하며 Festum에게 쫓기는 비행기를 구하기 위해 Kazuki가 명령을 어긴다
- 5화 · Hester Gallop이 Festum의 기습 공격 중 approaching fleet과 섬을 향해 Fafner Mark Sechs를 요청하다
- 6화 · 쇼코가 페스텀을 파괴하기 위해 자신을 희생하고 카즈키가 첫 번째 위협을 처리한다
- 7화 · 코요는 쇼코를 애도하고 사쿠라는 페인트볼 훈련 중 죽음을 용기로 여기며 염색체 변화가 일어난다
- 8화 · 팀이 섬을 탐험하고 마야가 부상자를 치료하며 코요가 레드 코어에서 등장한다.
- 9화 · 코요가 페스텀의 공격을 받아 부모와 함께 섬에서 추방되며 바다로 끌려간다.
- 10화 · 카즈키는 소우시의 부상을 초래한 것을 기억하고 히로토가 반란을 일으키며 마야가 방문하고 카즈키가 수정 성장을 보여준다.
- 11화 · Mark Elf를 타고 섬을 떠난 Kazuki와 Yukie, 도시에서 Festum과 Neo UN군대에 맞서다
- 12화 · 마모루와 다른 이들은 페스텀에 맞서 파프너를 조종하고, 카즈키는 구금되며 소우시의 숨겨진 감정이 드러난다.