Ep. 45: Masaru e Suguru si scontrano in un duello diretto presso la sede di Yggdrasil

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La squadra del DATS sale alla sede di Yggdrasil, affrontando cristalli che deviano i loro attacchi. Masaru, Agumon e Gotsumon si separano dal gruppo per affrontare Yggdrasil direttamente. Nel mondo reale, Craniamon incontra Garudamon e Chika, che lo assistono. Tornando nel Mondo Digitale, Masaru combatte Yggdrasil ma viene bloccato da uno scudo di forza. Sostenuto dai suoi amici, Masaru sconfigge l'entità. Mentre Yggdrasil cade, un vecchio amico arriva inaspettatamente. BanchoLeomon viene liberato dalla pietra, mentre Craniamon prende il suo posto. Segue una rivelazione scioccante: Yggdrasil si spaccia per BanchoLeomon, che si rivela essere il padre di Masaru.