1화: 리오르에서 아버지와 마주한 에드워드와 알폰스

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에드워드와 알폰스 엘릭은 어머니를 부활시키려다 실패해 알폰스는 몸을, 에드워드는 팔다리를 잃었던 과거를 회상한다. 현재 시점에서 두 형제는 리오르에 도착해 코넬로 신부의 기적을 알게 되고, 그가 등가교환을 우회하기 위해 철학자의 돌을 사용한다고 의심하며 조사에 나선다. 코넬로는 크레이에게 두 형제를 처치하라고 명하고, 로제는 알폰스를 보고 공포에 질려 도망친다. 코넬로는 키메라와 거대 조류를 동원해 공격하지만, 에드워드는 오토메탈 팔로 자신을 방어하며 기계적인 신체를 드러낸다. 코넬로는 에드워드가 풀메탈 알케미스트임을 알아보고, 두 형제가 인간 환금술이라는 최후의 죄를 저질렀음을 깨닫는다.