5화: Hester Gallop이 Festum의 기습 공격 중 approaching fleet과 섬을 향해 Fafner Mark Sechs를 요청하다
2004년 8월 2일 방영
Neo UN 사무총장 Hester Gallop은 Alvis 기지가 Fafner Mark Sechs를 잠수함을 통해 Neo UN 함대로 이송하도록 요구한다. 빈혈로 인해 Shoko가 실신하자 Koyo Kasugai가 간호실로 그녀를 방문하고, 이어 Kazuki와 Maya도 따라온다. Neo UN 함대가 섬에 접근하자 Festum의 갑작스러운 공격을 받는다. Kazuki는 함대를 보호하면서도 적과 맞서기 위해 준비한다. 두 번째 Festum이 섬의 보안망을 뚫고 진입하여 파일럿들을 공격하기 시작한다.
에피소드 수
- 1화 · 학교 가기 전 아픈 쇼코를 방문한 마야, 도쿄에서 돌아온 소우시와 등장하는 페스텀 위협
- 2화 · Kazuki는 Festum을 물리치기 위해 레일건을 받고 조종사가 되기로 결심한다.
- 3화 · 후미히코와 토미 박사가 부모의 절망과 유령의 수수께끼 속에서 파프너 조종사 훈련을 위한 아이들을 선발하다
- 4화 · 섬이 이동하며 Festum에게 쫓기는 비행기를 구하기 위해 Kazuki가 명령을 어긴다
- 5화 · Hester Gallop이 Festum의 기습 공격 중 approaching fleet과 섬을 향해 Fafner Mark Sechs를 요청하다
- 6화 · 쇼코가 페스텀을 파괴하기 위해 자신을 희생하고 카즈키가 첫 번째 위협을 처리한다
- 7화 · 코요는 쇼코를 애도하고 사쿠라는 페인트볼 훈련 중 죽음을 용기로 여기며 염색체 변화가 일어난다
- 8화 · 팀이 섬을 탐험하고 마야가 부상자를 치료하며 코요가 레드 코어에서 등장한다.
- 9화 · 코요가 페스텀의 공격을 받아 부모와 함께 섬에서 추방되며 바다로 끌려간다.