4화: 섬이 이동하며 Festum에게 쫓기는 비행기를 구하기 위해 Kazuki가 명령을 어긴다
2004년 7월 26일 방영
Kazuki는 개입 금지라는 특정 명령을 무시하고 Festum에게 쫓기는 구조 비행기를 구한다. 섬의 위치가 이동하면서 비행기는 계속되는 전투를 목격한다. 추가 피해를 막기 위해 섬은 위장을 해제한다. 여성 코어가 Fafner가 바다로 가라앉는 것을 막는 동시에 Festum을 포획한다. 이로 인해 Kazuki는 외계 생명체를 격추시킬 수 있다. 섬의 실체가 드러났기 때문에 구조 비행기는 본부로 보고를 전송한다.
에피소드 수
- 1화 · 학교 가기 전 아픈 쇼코를 방문한 마야, 도쿄에서 돌아온 소우시와 등장하는 페스텀 위협
- 2화 · Kazuki는 Festum을 물리치기 위해 레일건을 받고 조종사가 되기로 결심한다.
- 3화 · 후미히코와 토미 박사가 부모의 절망과 유령의 수수께끼 속에서 파프너 조종사 훈련을 위한 아이들을 선발하다
- 4화 · 섬이 이동하며 Festum에게 쫓기는 비행기를 구하기 위해 Kazuki가 명령을 어긴다
- 5화 · Hester Gallop이 Festum의 기습 공격 중 approaching fleet과 섬을 향해 Fafner Mark Sechs를 요청하다
- 6화 · 쇼코가 페스텀을 파괴하기 위해 자신을 희생하고 카즈키가 첫 번째 위협을 처리한다
- 7화 · 코요는 쇼코를 애도하고 사쿠라는 페인트볼 훈련 중 죽음을 용기로 여기며 염색체 변화가 일어난다
- 8화 · 팀이 섬을 탐험하고 마야가 부상자를 치료하며 코요가 레드 코어에서 등장한다.