Tsuki wa Higashi ni Hi wa Nishi ni: Operation Sanctuary

Naoki Kuzumi, un estudiante de tercero de secundaria, vive con su tía, su tío y su primo desde que perdió a sus padres en un accidente. Cree que su vida es normal, salvo por no recordar sus primeros años. Un día, mientras se echa una siesta en un banco, una chica de cabello rojizo llamada Mikoto cae encima de él. Ella cree equivocadamente que es su hermano menor. La época en que vive Naoki sirve como refugio para personas del futuro, donde muchas sufren de una enfermedad incurable. Mikoto viajó hacia atrás en el tiempo después de enterarse de que su hermano había sido enviado a este periodo.