Tsuki wa Higashi ni Hi wa Nishi ni: Operation Sanctuary

Naoki Kuzumi, seorang siswa kelas tiga SMA, tinggal bersama pamannya, bibinya, dan keponakannya setelah kehilangan orang tuanya dalam sebuah kecelakaan. Ia menganggap hidupnya normal, kecuali ia tidak ingat masa-masa awal hidupnya. Suatu hari, saat sedang tidur siang di bangku, seorang gadis berambut merah bernama Mikoto jatuh ke atasnya. Ia secara keliru mengira bahwa Naoki adalah adik laki-lakinya. Zaman di mana Naoki tinggal menjadi tempat perlindungan bagi orang-orang dari masa depan, di mana banyak yang menderita penyakit tidak bisa disembuhkan. Mikoto melakukan perjalanan kembali ke masa lalu setelah mengetahui bahwa adiknya dikirim ke periode ini.