Tsuki wa Higashi ni Hi wa Nishi ni: Operation Sanctuary

Lise ikinci sınıf öğrencisi Naoki Kuzumi, ebeveynlerini bir kazada kaybeden ve annesinin kardeşi, amcası ve kuzeniyle yaşayan bir çocuktur. Hayatının normal olduğunu sanıyor, sadece erken çocukluk yıllarını hatırlamıyor. Bir gün, bankta uykuya dalmışken kırmızı saçlı bir kız olan Mikoto onun üzerine düşer. O, yanlışlıkla Naoki'yi küçük kardeşi sanar. Naoki'nin yaşadığı dönem, gelecekten gelen insanların sığındığı bir sığınağıdır ve bu insanlardan çoğu tedavi edilemez bir hastalıkla uğraşmaktadır. Mikoto, kardeşinin bu döneme gönderildiğini öğrenince zaman makinesiyle geri dönmüştür.