Pocket Monsters: Mewtwo! Ware wa Koko ni Ari

Giovanni, pemimpin Team Rocket, menemukan Mewtwo di bagian terpencil wilayah Johto dan berusaha menangkapnya kembali. Pada saat yang sama, Ash dan teman-temannya menjadi sandera oleh Domino, seorang anggota baru Team Rocket, saat berusaha menyelamatkan Pikachu dari Jessie dan James. Beberapa Pokémon hasil kloning juga ditangkap dan digunakan sebagai umpan untuk menarik Mewtwo. Konflik berkembang menjadi pertarungan antara Giovanni dan Mewtwo yang berfokus pada isu kontrol dan tujuan hidup. Mewtwo juga berusaha memahami apakah dirinya dan para klon memiliki peran yang berarti, meskipun diciptakan secara ilmiah.