Pocket Monsters: Mewtwo! Ware wa Koko ni Ari

Giovanni, líder da Equipe Rocket, localiza o Mewtwo em uma região isolada de Johto e tenta recapturá-lo. Nesse meio tempo, Ash e seus companheiros são feitos reféns por Domino, uma nova recruta da Equipe Rocket, enquanto tentam salvar o Pikachu de Jessie e James. Vários Pokémon clonados também são capturados e usados como isca para atrair o Mewtwo. O conflito se intensifica em uma batalha entre Giovanni e Mewtwo, centrada na luta pelo controle e pelo propósito. Mewtwo também busca entender se ele e os clones têm algum papel significativo, apesar de terem sido criados por meios científicos.