Classmate (♀) to Meikyuu no Futekisetsu na Kouryakuhou

Le lycée Nishi est sur le point de fermer ses portes dans deux ans, et son effectif scolaire s'est réduit à sept élèves, dont Hazakura Motoya, qui reste pour l'année scolaire gratuite. Trois nouvelles élèves transférées — Kayama, Mizumura et Toujou — arrivent soudainement. Elles font partie d'une unité militaire placée directement sous les ordres du président. Peu de temps après leur arrivée, une immense tour apparaît sur le terrain de l'école. Seuls quelques-uns peuvent la voir, et les récents progrès militaires du pays seraient issus des données recueillies à l'intérieur. Motoya est choisi pour entrer dans la tour avec les trois filles afin d'en percer les secrets.