Classmate (♀) to Meikyuu no Futekisetsu na Kouryakuhou

Nishi Lisesi iki yıl içinde kapanacak ve öğrenci sayısı Hazakura Motoya dahil olmak üzere sadece yedi kişiye düşmüştür. Okulun son ücretsiz yılını geçirmek isteyen Motoya, beklenmedik şekilde Kayama, Mizumura ve Toujou adlı üç yeni kız öğrenciyle karşılaşır. Bu üçlü, başkanın doğrudan emri altında çalışan bir askeri birliğe aittir. Onların gelmesinden kısa bir süre sonra okul bahçesinde dev bir kule belirir. Sadece seçkin bazı kişiler bu kuleyi görebilir ve ülkenin son askeri gelişmelerinin verilerinin büyük kısmı buradan toplanmaktadır. Motoya, kuledeki sırları araştırmak üzere bu üç kızla birlikte kuleye girmek üzere seçilir.