Classmate (♀) to Meikyuu no Futekisetsu na Kouryakuhou

La Nishi High School sta per chiudere tra due anni e il numero degli studenti si è ridotto a sette, tra cui Hazakura Motoya, che rimane per l'ultimo anno scolastico gratuito. Tre nuove studentesse trasferite—Kayama, Mizumura e Toujou—arrivano inaspettatamente. Fanno parte di un'unità militare che opera sotto il diretto comando del presidente. Subito dopo il loro arrivo, su un lato del terreno scolastico appare una torre gigantesca. Solo pochi possono vederla, e si dice che gli ultimi progressi militari del paese derivino dai dati raccolti al suo interno. Motoya viene scelto per entrare nella torre insieme alle tre ragazze per indagarne i segreti.