Ep. 5: Izana e Tsumugi ricevono protesi e rigenerazione mentre Sidonia arriva nel Sistema Stellare Lem
In onda il 10 maggio 2015

Izana riceve protesi per il braccio destro e la gamba sinistra perduti, mentre Tsumugi si sottopone a rigenerazione in una camera speciale. Nagate è depresso per le condizioni di Tsumugi ma riacquista il morale sapendo del suo completo recupero. Sidonia raggiunge il Sistema Stellare Lem per affrontare i Gauna, attivando i retrorazzi per decelerare. Questa manovra mette quasi in pericolo la vita di Nagate e Izana mentre esplorano i tunnel, ma permette a Tsumugi di osservare l'Area Residenziale tramite una sonda, portandole gioia. Di ritorno nel dormitorio, Nagate viene informato che la sua stanza è riservata a un altro cadetto, costringendolo a trasferirsi. Chiede quindi a Izana di poter alloggiare a casa sua, sorprendendola.
Episodi
- Ep. 1 · Kunato e Mozuki intrappolati dai parassiti e costretti a controllare gli altri mentre Nagate affronta la perdita e la battaglia.
- Ep. 2 · Tsumugi rivela la sua natura di Chimera dopo la battaglia mentre Kobayashi mette in salvo i dati di ricerca
- Ep. 3 · Sidonia si dirige verso il sistema stellare di Lem mentre Tsumugi affronta una minaccia nascosta dei Gauna.
- Ep. 4 · Tsumugi protegge Sidonia da un raggio Gauna mentre Nagate distrugge il nucleo principale.
- Ep. 5 · Izana e Tsumugi ricevono protesi e rigenerazione mentre Sidonia arriva nel Sistema Stellare Lem
- Ep. 6 · Nagate cerca alloggio vicino a Tsumugi mentre il test dell'Emissore a Fascio Gravitazionale si conclude con una crescita imprevista di tentacoli.
- Ep. 7 · I Guardiani gestiscono un malfunzionamento dell'arma mentre i piloti affrontano nuovi test dell'armatura e rivelazioni personali.
- Ep. 8 · Nagate e Izana incontrano Yuhata a casa prima che Yure cerchi l'aiuto di Sasaki per il test dell'emettitore.
- Ep. 9 · Izana sostituisce un disertore e combatte un nuovo tipo di Gauna mentre Nagate guarda impotente.