Ep. 9: Izana sostituisce un disertore e combatte un nuovo tipo di Gauna mentre Nagate guarda impotente.
La visita di Nagate e Izana viene interrotta quando Yuhata e Tsumugi spiano. Izana scopre che Nagate è stato incastrato dalla nonna e si arrabbia, costringendo Yuhata e Tsumugi a tornare a casa svegli e preoccupati. Nel frattempo, Sidonia raggiunge il Sistema Stellare di Lem per assicurarsi una testa di ponte sul pianeta Lem IX. Viene organizzata una squadra di ricognizione composta da quattro piloti a bordo dell'Hayakaze, ma dopo che un pilota selezionato diserta e viene arrestato per tradimento, Izana viene assegnata come sostituta. A metà missione, Izana rileva un oggetto sconosciuto che si rivela essere un nuovo tipo di Gauna. Sia Nagate che Tsumugi osservano impotenti attraverso il monitor mentre Izana e il suo team lottano contro il nemico.
Episodi
- Ep. 5 · Izana e Tsumugi ricevono protesi e rigenerazione mentre Sidonia arriva nel Sistema Stellare Lem
- Ep. 6 · Nagate cerca alloggio vicino a Tsumugi mentre il test dell'Emissore a Fascio Gravitazionale si conclude con una crescita imprevista di tentacoli.
- Ep. 7 · I Guardiani gestiscono un malfunzionamento dell'arma mentre i piloti affrontano nuovi test dell'armatura e rivelazioni personali.
- Ep. 8 · Nagate e Izana incontrano Yuhata a casa prima che Yure cerchi l'aiuto di Sasaki per il test dell'emettitore.
- Ep. 9 · Izana sostituisce un disertore e combatte un nuovo tipo di Gauna mentre Nagate guarda impotente.
- Ep. 10 · La squadra di Izana combatte i Gauna mentre Nagate pilota il Tsugumori Kai Ni per salvarli.
- Ep. 11 · Izana e il suo compagno esplorano la superficie di Lem IX mentre Nagate combatte i Gauna e Tsumugi affronta Benisuzume
- Ep. 12 · Nagate torna a Sidonia dopo la conquista planetaria mentre Kunato osserva una chimera incompleta.