Ep. 9: Koyo diserang Festum dan terseret ke laut saat orang tuanya diasingkan.
Tayang pada 6 September 2004
Koyo tiba-tiba diserang oleh Festum, memaksanya menyerahkan kapal selam yang membawa Maya dan Kyouhei sebelum ditarik ke dalam laut. Sakura mengekstrak kokpit dari Fafner Koyo tepat saat pulau itu hancur. Tampak jelas bahwa Koyo telah kehilangan banyak ingatannya, dan anak-anak lain menemukan bahwa sistem saraf pusatnya telah diassimilasi. Sementara itu, orang tua Koyo mengalami kesulitan membesarkan anak yang kini mereka anggap tidak berguna, yang mengakibatkan mereka diusir dari pulau tersebut.
Episode
- Ep. 5 · Hester Gallop meminta Fafner Mark Sechs saat Festum menyerang armada dan pulau yang mendekat.
- Ep. 6 · Shoko mengorbankan dirinya untuk menghancurkan Festum sementara Kazuki menangani ancaman pertama.
- Ep. 7 · Koyo berduka atas Shoko sementara Sakura memandang kematian sebagai keberanian selama pelatihan paintball dan perubahan kromosom.
- Ep. 8 · Tim menjelajahi pulau itu sementara Maya merawat personel yang terluka dan Koyo muncul dari inti merah.
- Ep. 9 · Koyo diserang Festum dan terseret ke laut saat orang tuanya diasingkan.
- Ep. 10 · Kazuki mengingat telah melukai Soushi sementara Hiroto memberontak sebelum Maya berkunjung dan Kazuki menunjukkan pertumbuhan kristal.
- Ep. 11 · Kazuki dan Yukie meninggalkan pulau dengan Mark Elf, tiba di kota di mana mereka menghadapi Festum dan ditangkap oleh pasukan Neo UN.
- Ep. 12 · Mamoru dan lainnya mengemudikan Fafner melawan Festum sementara Kazuki menghadapi penahanan dan perasaan tersembunyi Soushi muncul.
- Ep. 13 · Mitsuhiro menjelaskan kehancuran Jepang dan genosida Festum sementara Hester memperkenalkan senjata baru.