Shinkansen Henkei Robo Shinkalion: Mirai kara Kita Shinsoku no ALFA-X

Um grupo de pesquisa chamado Instituto de Evolução Ultra Shinkansen investiga ataques de monstros no Japão após a aparição de um misterioso Black Shinkansen. Sua principal defesa são os Shinkalions, trens-bala capazes de se transformar em grandes mechas. Hayato Hayasugi, um fã de trens, descobre a participação de seu pai no SUEI e acaba se tornando um piloto de Shinkalion. Juntamente com outras crianças, ele assume a responsabilidade de defender contra ameaças ultraterrenas. Um novo inimigo do espaço chega com planos de conquistar a Terra. O SUEI lança um novo protótipo, o ALFA-X, mas o pai de Hayato, Hokuto, desaparece. Uma versão de nove anos de Hokuto viaja no tempo até o presente para ajudar na batalha, pilotando o ALFA-X.