Shinkansen Henkei Robo Shinkalion: Mirai kara Kita Shinsoku no ALFA-X

一個名為「新幹線超進化研究所」（Shinkansen Ultra Evolution Institute）的研究小組，正在調查日本出現神秘黑新幹線後所引發的怪獸攻擊事件。他們的主要防禦武器是「新幹人」（Shinkalion），一種能變形成巨大機器人的高速列車。熱愛火車的少年早織遙太（Hayato Hayasugi）發現父親與SUEI的關聯，意外成為新幹人駕駛員。他與其他孩子們一起承擔起對抗異界威脅的責任。此時，來自外太空的新敵人企圖征服地球，SUEI派出新型號的試作機「ALFA-X」，但遙太的父親早織北斗（Hokuto）卻突然失蹤。令人驚訝的是，年僅九歲的北斗穿越時空來到現在，駕駛ALFA-X協助戰鬥。