Ep. 46: Emerl impazzisce durante le finali, costringendo gli altri a combatterlo.
In onda il 15 febbraio 2004

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Il torneo raggiunge la fase finale, ma Emerl reagisce con violenza all'Emerald del Caos e inizia ad attaccare tutti. Gli altri personaggi devono unire le forze per fermare la sua furia. Emerl si rivela un avversario pericoloso perché la sua abilità Skill Get gli permette di copiare i movimenti degli avversari. Questo episodio segna la conclusione dell'arco narrativo tratto dal videogioco Sonic Battle.
Episodi
- Ep. 42 · Sonic rompe un appuntamento con Amy, portandola a viaggiare con Sam Speed mentre il mech di Eggman tenta una fuga di prigione.
- Ep. 43 · Decoe e Bocoe impiantano chip negli elettrodomestici mentre sono imprigionati con Eggman
- Ep. 44 · Stewart cerca Eggman fuggito ma si allea con Chris e amici
- Ep. 45 · Il presidente organizza un torneo di arti marziali con il Chaos Emerald come premio per catturare Eggman
- Ep. 46 · Emerl impazzisce durante le finali, costringendo gli altri a combatterlo.
- Ep. 47 · Eggman pianifica la distruzione planetaria tramite una corazzata e l'ombelico del mondo, costringendo Sonic ad affrontare sfide impreviste.
- Ep. 48 · Sonic e i compagni inseguono Eggman nel regno sotterraneo del cratere vulcanico.
- Ep. 49 · Il governo avverte di un'ipotetica stagnazione temporale se Sonic rimane, mentre Chris si rifiuta di lasciarlo andare.
- Ep. 50 · Tails e Chuck corrono contro il tempo per costruire un dispositivo di ritorno dimensionale mentre la GUN attacca inaspettatamente la base di Eggman.