第 39 集: Mustang 發現 Kimblee 歸隊，Elrics 在 Ishbal 廢墟中揭開 Scar 的 Grand Arcanum 真相。
2004年7月10日 播出原創回
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在前往 Lior 附近軍事基地的途中，Mustang 得知 Kimblee 已被新晉升的 Colonel Archer 重新任命為國家鍊金術師。抵達 Ishbal 後，Elrics 和 Marta 只發現廢墟，並遇見了二等少尉 Breda 和 Havoc，隨後將他們交由 Mustang 監督。之後，Mustang 向 Ed 展示了 Lior 的空中影像，畫面中 Scar 拖動巨石刻畫出巨大的 Grand Arcanum 鍊成陣，令 Ed 深感震驚。為了尋求答案，Ed 向 Colonel Archer 申請潛入 Lior。Archer 批准了請求，但堅持要求 Al 留守，以防 Ed 擅自離隊。出發前，Ed 將他的銀色懷錶交給了 Armstrong。
集數
- 第 35 集 · 色慾與她的同類在餐廳遇見來自她過去的盧瓏。
- 第 36 集 · Edward和Alphonse協助Ishbal難民前往Ishbal途中
- 第 37 集 · 哈維克中尉的戀愛煩惱與第十三倉庫之謎
- 第 38 集 · 愛德華與阿爾馮斯因毀壞拖拉機而分道揚鑣，溫莉與雪斯卡則展開對休斯謀殺案的調查。
- 第 39 集 · Mustang 發現 Kimblee 歸隊，Elrics 在 Ishbal 廢墟中揭開 Scar 的 Grand Arcanum 真相。
- 第 40 集 · 愛德與羅茲重逢並對抗斯卡，瑪塔對決金布利，布拉德雷揭露真實身份。
- 第 41 集 · Scar 指揮 Lior 平民，Ed 警告 Mustang，Lust 加入 Scar 協助鍊成賢者之石。
- 第 42 集 · 艾爾凡斯在斯卡對軍隊的最後行動後煉成利奧爾市
- 第 43 集 · 霍恩海姆與溫莉相遇，而馬斯丹追擊愛德華與阿爾馮斯前往利塞姆布爾。