16화: 마이하마 서버가 초기화되고 리요코가 혼수상태로 돌아오며 교가 실존적 고통에 직면한다
2006년 7월 20일 방영

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The Maihama server resets and the summer school term starts again; Ryoko returns to the server, but is hospitalized and comatose. Kyo discovers that Ryoko can only exist as herself within the Altair, which causes pain for them as well as those around them. (Source: Wikipedia)
에피소드 수
- 12화 · 오세아누스 조가 레오키, 하야세, 토미가이를 세레브란트 후보로 조사하다
- 13화 · 료코가 교의 파일럿이 되지만 신에 의해 제가파인 알타이가 파괴되면서 사망한다.
- 14화 · 료코에 대한 키요의 애도, 루 쉥의 인간 서버 저장소 설명, 시즈노의 알타이르 데이터 내 료코 위치 확인
- 15화 · 교가 서버 리셋의 현실을 직면하고, 제가페인 헤라슬벨그르가 코알리크웨와 전투 중 심각한 피해를 입는다.
- 16화 · 마이하마 서버가 초기화되고 리요코가 혼수상태로 돌아오며 교가 실존적 고통에 직면한다
- 17화 · 시마와 시즈노가 제가페인 칼라드리아스를 탐사하는 동안 신은 오세아누스에 침투하여 세레브랜츠들을 심문한다.
- 18화 · 리요코의 감정이 알타이어에 갇힌 채, 키요와 리요코가 리얼 월드를 탐험하는 동안
- 19화 · 긴장감 넘치는 저녁 식사 자리에서 루 쉥이 시즈노의 예할 정체를 의심한다.
- 20화 · 시즈노와 시마가 전작 교우에 의해 마이하마 서버가 달로 이전되었음을 밝힘