Ép. 3: Les Elric apprennent l'alchimie de leur père, font face à la mort de leur mère et tentent une transmutation humaine aux résultats tragiques.

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Un flashback s'étendant jusqu'à l'épisode neuf détaille la formation alchimique précoce des Elric sous la direction de leur père absent, Hohenheim of Light. Après avoir démontré leurs compétences à leur amie Winry Rockbell et à leur mère Trisha, les frères la perdent suite à une maladie soudaine et jurent de la ressusciter. Ils s'entraînent sous la tutelle d'un alchimiste non identifié avant de tenter la transmutation humaine, qui échoue de manière catastrophique. Edward perd sa jambe gauche et Alphonse perd tout son corps. Pour sauver son frère, Edward sacrifie son bras droit pour lier l'âme d'Alphonse à un armure. Roy Mustang arrive après avoir reçu une lettre concernant leur père, témoin des conséquences. Il tente de les recruter en tant qu'alchimistes d'État, mais Pinako Rockbell lui ordonne de partir. Edward paie pour des membres automail et décide de devenir alchimiste d'État pour accéder à la bibliothèque de l'État et restaurer Alphonse. Les frères brûlent leur maison d'enfance à Resembool pour tourner la page.