第3話: エドワードとアルフォンスは父から錬金術を学び、母の死に向き合い、人体錬成に挑んで悲劇的な結果を迎える

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エピソード9にわたる回想シーンでは、光のホーエンハイムという不在の父のもとでエドワードとアルフォンスが幼少期に錬金術の訓練を受ける様子が描かれる。友人のウィンリー・ロックベルと母のトリーシャに技を見せた後、兄弟は突然の病でトリーシャを失い、彼女を蘇らせることを誓う。彼らは名前のない錬金術師の下で訓練を重ねた後、人体錬成に挑むが、それは大惨事に終わる。エドワードは左足を失い、アルフォンスは全身を失う。兄を救うため、エドワードは右腕を犠牲にしてアルフォンスの魂を鎧に縛り付ける。父に関する手紙を受け取ったロイ・マスタングが現場に到着し、その惨状を目撃する。彼は兄弟を国家錬金術師として採用しようとするが、ピナコ・ロックベルに追い払われる。エドワードはオートメイルの代金を支払い、州の図書館にアクセスしてアルフォンスを取り戻すために国家錬金術師になることを決意する。兄弟は前を向くため、レゼンブルの幼少期の家を焼き払う。