एपि. 3: एल्रिक परिवार को अलकेमी की शिक्षा, उनकी माँ की मृत्यु और मानव रूपांतरण का दुखद परिणाम

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एपिसोड नौ तक फैले इस फ्लैशबैक में एल्रिक भाइयों के अनुपस्थित पिता, Hohenheim of Light के तहत उनकी प्रारंभिक अलकेमी प्रशिक्षण का विवरण दिया गया है। दोस्त Winry Rockbell और माँ Trisha के सामने अपनी कौशल प्रदर्शित करने के बाद, भाइयों को अचानक बीमारी के कारण उनकी माँ का निधन हो जाता है और वे उसे पुनर्जीवित करने का संकल्प लेते हैं। वे एक अनाम अल्केमिस्ट के तहत प्रशिक्षण लेते हैं और मानव रूपांतरण का प्रयास करते हैं, जो विनाशकारी रूप से विफल हो जाता है। Edward को अपना बायाँ पैर खो देता है, और Alphonse अपना पूरा शरीर खो देता है। अपने भाई को बचाने के लिए, Edward अपने दाहिने हाथ का त्याग करता है ताकि Alphonse की आत्मा को एक कवच के सूट में बाँध सके। उनके पिता के बारे में एक पत्र प्राप्त करने के बाद Roy Mustang वहाँ पहुँचता है और परिणामों को देखता है। वह उन्हें राज्य अल्केमिस्ट के रूप में भर्ती करने का प्रयास करता है, लेकिन Pinako Rockbell उसे दूर जाने का आदेश देती है। Edward ऑटोमेल अंगों के लिए भुगतान करता है और Alphonse को पुनर्स्थापित करने के लिए राज्य पुस्तकालय तक पहुँच प्राप्त करने के लिए राज्य अल्केमिस्ट बनने का निर्णय लेता है। आगे बढ़ने के लिए भाइयों ने Resembool में अपने बचपन के घर को जला दिया।