Ep. 48: Mari rivela la verità sulla separazione dei gemelli di Yuri prima che Yuri ritorni come discendente di Duo.
In onda il 4 settembre 2004

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Dopo aver assistito alla presunta morte della signora Yuri, la signora Mari rivela che Yuri è sua sorella gemella, separata durante l'infanzia. La signora Yuri torna inaspettatamente e riceve l'ordine di eliminare la sorella. Cattura Misaki come ostaggio, rivelando la sua identità come discendente superumano di Duo, una forza intergalattica imminente sulla Terra. Lan e i bambini tentano di intervenire contro la signora Yuri, che utilizza un Dark SynchroChip in combattimento. Nonostante i suoi sforzi, viene persuasa ad abbandonare Nebula. Il conflitto si conclude con l'apparizione di Dark ProtoMan, che attacca e presumibilmente uccide sia la signora Yuri che Misaki.
Episodi
- Ep. 44 · Lan e Maylu scoprono una lampada magica nelle rovine antiche durante le vacanze estive.
- Ep. 45 · Rush scappa dopo sentirsi trascurato dal nuovo gattino di Maylu
- Ep. 46 · La grande battaglia della NetPolice!
- Ep. 47 · Lan viaggia nello spazio con Yai per fermare il Dr. Regal nonostante gli ordini dei NetSavers
- Ep. 48 · Mari rivela la verità sulla separazione dei gemelli di Yuri prima che Yuri ritorni come discendente di Duo.
- Ep. 49 · I NetSavers tentano di curare ProtoMan utilizzando una VaccineChip in un hotel abbandonato.
- Ep. 50 · ShadeMan risorto punta al Dr. Regal mentre Lan interviene a DenTech City
- Ep. 51 · Dr. Regal si fonde con LaserMan per attaccare le città mentre Lan lo affronta usando DoubleSoul CrossFusion.